Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVV-2B6SEH9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms