Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms