Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms