Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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