Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD54BQ9Y620 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAD54BQ9Y620 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms