Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms