Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNMA3Q9UL41 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms