Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms