Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CPNE7Q9UBL6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CPNE7Q9UBL6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CPNE7Q9UBL6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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