Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HACD3Q9P035 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms