Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms