Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRC3Q9BY71 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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