Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms