Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms