Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms