Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNS3Q9BQ31 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms