Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
RETNLBQ9BQ08 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms