Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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