Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms