Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms