Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms