Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms