Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms