Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms