Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN4Q92575 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms