Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEST4Q8NFU0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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