Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMIEQ8NEW7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms