Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms