Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms