Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms