Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FREM1Q5H8C1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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