Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGO1Q5FBB7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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