Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PAN3Q58A45 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PAN3Q58A45 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms