Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms