Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms