Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms