Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP28Q4G0W2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms