Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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