Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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