Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms