Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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E2F4Q16254 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
E2F4Q16254 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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