Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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VAMP3Q15836 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VAMP3Q15836 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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