Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CST6Q15828 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CST6Q15828 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms