Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC006547.1-207ENST00000601746 930 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC006547.1-210ENST00000609644 589 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 PRAMEF35P-201ENST00000458709 891 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RYR3Q15413 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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