Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GBX1Q14549 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX1Q14549 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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