Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PKP1Q13835 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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