Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1SQ13698 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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