Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PMS2P11Q13670 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms