Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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