Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HSPA14-202ENST00000437161 1689 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UBE2V1Q13404 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms